在遥远未来的公元2195年，人类在火星的殖民地被称为“木星蜥蜴”的神秘木星生物袭击，由于彼此科技有差距，地球军大败，火星殖民地被摧毁，地球连合军立刻提升军力以备战敌人而此时一个不属于地球政府的私人集团——尼尔加(NERGAL)重工，研制了一艘火力强大、站在人类科技尖端的的宇宙战舰，这艘战舰的名字就叫做抚子(NADESICO)本故事就讲述一班在抚子号上的成员的经历，他们一方面和木星蜥蜴作战，另一方面...

达拉克帝国是一个完全只有男人的国家，而美洁尔则是个百分之百的女人国，两边长期以来就互相仇视、战火连连。渡海响是一名机械工，在达拉克帝国中属于地位卑微的三等国民阶级，原本潜入「雷号舰」盗取「蛮型机」机械人只是为了面子，不料却碰上美洁尔女人国来袭而被卷入战争中，从此改变了他的命运…影片展现了深刻的社会主题，让人深思熟虑！...

分隔在两个世界的爱力克兄弟二人，使用各自的手段尝试着兄弟再会。 哥哥爱德华穿过“门”来到真实世界。公元1923年的德国慕尼黑，一场世界大战即将到来。无法在这个世界使用炼金术的爱德华，与长相酷似弟弟的青年爱尔凡斯一起研究火箭的科技，希望借助火箭回到原来的世界。另一边的炼金术世界，弟弟阿尔冯斯修行炼金术，打扮宛若曾经的爱德华，与国家炼金术士们一起寻找找回哥哥的方法。 而暗地中，慕尼黑的一个神秘组织开始...